Le Shiatsu considère l'être humain comme un système multifonctionnel, composé d'éléments énergétiques, psychiques et physiques dans un état d'interdépendance constante, où l'absence de santé, et donc de bien-être, est l'expression concrète et perceptible de la perte d'équilibre énergétique ou “disharmonie”. La disharmonie, et l'inconfort qui en résulte pour le corps et l'esprit, est causée par un déséquilibre énergétique interne qui s'exprime principalement dans l'occlusion du méridien coulissant, avec en conséquence des dommages supplémentaires à l'organe ou à l'intestin relié au méridien lui-même.
Le shiatsu, pratiqué correctement, est efficace car il permet de «libérer» les canaux o ù circule l'énergie vitale, permettant une meilleure circulation de l'énergie elle-même, restaurant les fonctions qui permettent au corps de retrouver l'équilibre et harmonie avec lui-même et avec le milieu environnant.