Il est fort probable que les conditions météo influenceront considérablement vos vacances à Joniškėlis, mais rappelez-vous que votre destination renferme des options sympas et à prix léger pour vous amuser lorsque le beau temps n'est pas au rendez-vous. Les mois les plus chauds sont généralement juillet et août, avec une température moyenne de 17 °C, tandis que les mois les plus froids sont janvier et février, avec une moyenne de -2 °C. Les mois les plus enneigés à Joniškėlis sont janvier, février, décembre et novembre avec une moyenne de 34 cm de neige enregistrée chaque mois.